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重测序时代的植物遗传研究(Historical opportunity of plant genetic study by genome re-sequencing combined with CRISPR-Cas9 technology)

日期: 2016-03-18

我院2016年度春季学期学术系列讲座之二

题目:重测序时代的植物遗传研究

Historical opportunity of plant genetic study by genome re-sequencing combined with CRISPR-Cas9 technology

讲座人:田大成,博士

南京大学教授

时间:2016年3月18日,13:00-14:30

地点:新葡萄8883官网AMG邓祐才报告厅

联系人:陆剑

摘要:

自孟德尔遗传定律发表以来,遗传学整整走过了150年。随着重测序和基因敲除等系列生物技术的重大突破,植物遗传研究迎来了“随心所欲”的时代:拥有几乎完备的技术手段,来检测可以想到的种种科学问题、分离与克隆想要的种种基因、应用重要的基因开辟新兴产业。为此各以一例予以探讨:1)生物多样性分子层面的“正反馈”现象。我们利用自花传粉植物,构建了经历一次减数分裂的纯合与杂合体,直接测序检测突变的数量,结果表明染色体的异质性可促进突变。即生物多样性越高的区段或个体,突变率也越高。该机制为近年来观察到的突变热点提供了新的解释;表明达尔文进化论中的遗传变异与自然选择,不完全是一种先后的关系;突变率本身也是自然选择的结果,反过来促进自然选择的效率。2)解析引起水稻“绿色革命”的相关基因。绿色革命是水稻生产史上的重大事件,使水稻产量与株型都产生了革命性变化。利用第一代绿色革命育成的品种IR8及其衍生的系列品种,组成一个系谱链,然后用经典遗传学计算出每个品种遗传份额的理论预期,通过基因组测序追踪相关基因,再用CRISPR验证这些基因敲除后的表型,从而确定绿色革命过程中的重要基因。 3) 植物分子抗病育种新途径的研究,包括高通量克隆抗病基因的方法,筛选抗病基因“富集簇”及其分子育种途径。

报告人简介:

田大成,南京大学教授。58年下乡务农20年,其间农村科学试验卓有成效,每年迎来成千上万人的参观,被万县地区科学大会评为有重大贡献的单位。78年自学考上大学, 获四川农大硕士、 南京农大博士、澳大利亚Newcastle 大学博士学位。 曾任巫溪县农业局技术干部、四川省种子公司高级农艺师、石柱县县长助理、四川农大水稻所博士后(副教授)、澳大利亚林业生物技术研究所(ForBio Research)研究员、芝加哥大学生态与进化系博士后,2003年由南大引进回国。

80年代初在基层工作两年,主动要求到低产的山区推广玉米高产新技术, 使该地产量成倍增长、一跃而为全地区的高产典型, 再次受到成千上万人的参观。80年代后期,带领20多人的协作组在杂交水稻制种方面作了大量试验研究,提出了水稻异交栽培的种种理论和技术,写成了“水稻异交栽培学”一书。 因其技术部分在生产上的广泛应用,获省科技进步一等奖和国家三等奖,并评为有突出贡献的专家获国务院特殊政府津贴; 在芝大和南大工作期间,主要从事遗传与进化研究。在植物的抗病基因、非对称序列的遗传、植物功能基因组、减数分裂的遗传效应等方面均有较深入的研究。其结果在Nature (2015,2008 & 2003)、Science (2001)、Proc Natl Acad Sci(2013,2012, 2006 & 2002)、Genome Biology(2015)、Mol Biol Evol (2009a,2009b & 2008))、New Phytologist (2015 & 2012)、Genetics (2010 & 2006) 和Plant J(2015) 等刊物发表。

欢迎各位老师同学积极参加!