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新葡萄8883官网AMG罗述金课题组揭示已灭绝爪哇虎和巴厘虎的遗传起源

日期: 2015-03-17

  新葡萄8883官网AMG罗述金课题组近日在Journal of Heredity发表题为“Genetic Ancestry of the Extinct Javan and Bali Tigers”的论文,运用古代DNA技术,第一次从已经灭绝的爪哇虎和巴厘虎标本中成功提取DNA进行序列分析,揭示其属于现代虎的两个亚种,而苏门答腊虎亚种与之亲缘关系最近。

  巴厘虎(Panthera tigris balica)和爪哇虎(Panthera tigris sondaica)是两个分别于20世纪4080年代灭绝的虎亚种,其遗传起源及其与其他虎亚种的系统发生关系一直困扰着动物学界。基于印度尼西亚爪哇岛和巴厘岛的相对地理隔绝性,以及对东南亚其他物种的生物地理学研究,曾有假说认为爪哇虎和巴厘虎是中更新世的古代虎的孑遗种群,与现代虎包括东北虎、孟加拉虎、马来虎、印支虎、华南虎和苏门答腊虎等亚种迥异。为了解决这一争议,罗述金课题组及合作者从中国、荷兰、英国、美国、德国、瑞典、俄罗斯多个博物馆采集了爪哇虎和巴厘虎的古旧骨骼或牙齿样品,运用古代DNA技术进行了研究。结果显示爪哇虎和巴厘虎均与现存的苏门答腊虎亲缘关系相近,在长达1750 bp的线粒体DNA片段上仅相差1-2个核苷酸,但是三者之间没有相同的线粒体单倍型,说明三个岛屿种群来源于一个较为近期的共同祖先种群,在末期冰川期之后形成地理隔离和亚种分化。现存苏门答腊虎与爪哇虎和巴厘虎遗传上的相似性,为可能的爪哇岛和巴厘岛上虎种群的重新引入提供了的科学合理的源种群基础。随着本研究工作的完成,首次完整揭示了现代虎所有9个亚种的进化历史和分子遗传学关系。

  罗述金研究员为该论文的通讯作者,北大生科院2012级本科生薛浩然为该论文的共同第一作者,该项目获得美国国立卫生研究院 (NIH),国家自然科学基金和北京大学-清华大学生命科学联合中心等经费的支持。

链接:http://jhered.oxfordjournals.org/cgi/content/full/esv002?ijkey=KpYc5X9jUpNPymA&keytype=ref

Citation:

Xue HR, Yamaguchi N, Driscoll CA, Han Y, Bar-Gal GK, Zhuang Y, Mazak JH, Macdonald DW, O’Brien SJ, Luo SJ* (2015). Genetic ancestry of the extinct Javan and Bali tigers. Journal of Heredity doi:10.1093/jhered/esv002


图注:巴厘虎(Panthera tigris balica)和爪哇虎(Panthera tigris sondaica)是两个分别于20世纪4080年代灭绝的虎亚种。基于古代DNA技术的系统发生分析,揭示了爪哇虎和巴厘虎属于现代虎的两个亚种,与之亲缘关系最近的为苏门答腊虎亚种[Xue et al., Journal of Heredity(2015)]